Geenitutkimus

1. CDPA/CDDY-geenitesti
2. Monimuotoisuustesti
3. Geeniyhdyshenkilöiden yhteystiedot
4. Yhteistyö Koirageenit-työryhmän kanssa

Koirilla tehtävä geenitutkimus ja sitä kautta erilaisten rotukohtaisten DNA-testien yleisyys tulee vain lisääntymään tulevina vuosina. Toivomme, että myös havannankoirat saavat tulevaisuudessa rodun sairauksiin ja luonneongelmiin yksilöityjä testejä, minkä avulla pystymme osaltaan helpottamaan sairauksien vastustusta rodussamme.

Havannalaiset ry teki tiivistä yhteistyötä Hannes Lohen Koirageenit-tutkimusryhmän kanssa havannankoiran lyhytkarvageenin löytymiseksi. Tutkimusryhmälle lähetettiin tuolloin kymmenien havannankoirien verinäytteet. Tuo yhteistyö oli osaltaan mahdollistamassa tänä päivänä käytössä olevan testin käyttämisen. Koirageenit-työryhmä on suomalainen tutkijaryhmä, joka tekee tärkeätä työtä etsiessään erilaisten perinnöllisten sairauksien ja käytösongelmien paikkoja koirien DNA:ssa ja monelle rodulle onkin jo pystytty paikantamaan erilaisia sairausgeenejä, mistä sitten on pystytty kehittämään geenitesti juuri sille rodulle, juuri siihen sairauteen.

Mikäli koirallasi todetaan jokin vakava perinnölliseksi katsottava sairaus, tarkista Koirageenit sivustolta, onko heillä menossa tutkimusta ko. sairauteen liittyen ja lähetä heille verinäyte sekä taustatietolomake koirastasi. Näin voit omalla toiminnallasi edesauttaa koirien terveyden hyväksi tehtävää geenitutkimusta. Koirageenit-tutkimusryhmä ottaa näytteitä vastaan myös sellaisista roduista/sairauksista, mistä ei ole juuri sillä hetkellä aktiivista tutkimusta käynnissä. Lisätietoja näytteiden lähettämisestä löydät täältä.

Koirilla tehtävä geenitutkimus on jo ollut myös suureksi avuksi ihmisten sairauksien hoidossa ja geneettisessä tutkimuksessakin.

9.1.2024 jälkeen Kennelliiton lähetteellä tilatut Kennelliiton hyväksymissä laboratorioissa tehdyt viralliset CDPA/CDDY-testien ja polveutumismääritystestien tulokset kirjataan Jalostustietokantaan. Kennelliitto hyväksyy seuraavien laboratorioiden tekemät testitulokset:

Labogen, Saksa: https://shop.labogen.com/fi/genetic-test-order/koira
Wisdom Panel = MyDogDNA: https://mydogdna.com/ 
Movet: https://www.movet.fi/ 

Lisäksi Havannalaiset ry hyväksyy kotisivuilleen virallisesti otettujen näytteiden testitulokset laboratorioilta:

Veterinary genetics laboratory UC Davis: https://vgl.ucdavis.edu/
Vetgen, USA:  https://vetgen.eu/en

Jos haluat järjestää joukkonäytteenoton paikkakunnallasi, ole yhteydessä geeniyhdyshenkilöihin.

Mikäli olet teettänyt havannankoirallesi terveyteen liittyvän, rodulle soveltuvan geenitestin, lähetä julkaisulupa ja kopio laboratoriolausunnosta osoitteella . Testin tulee olla havannankoiralle soveltuva ja terveysasioihin liittyvä. Listauksessa eläinlääkärin tai muun virallisen näytteenottajan (esimerkiksi aluekouluttajat ja kennelneuvojat) vahvistamat/ottamat testit merkitään erikseen *-merkillä.

Näytteitä ottavien aluekouluttajien/kennelneuvojien yhteystiedot löytyvät täältä.

CDPA/CDDY-geenitestistä

Vuonna 2009 tutkijat (Parker et al. 2009) löysivät lyhytjalkaisuuden aiheuttavan FGF4-geenin koiran kromosomista 18. Tästä puhutaan nykyään kondrodysplasiana (CDPA). Vuosia oli vahva epäilys, että tämä sama geeni aiheuttaisi myös kohonneen riskin ennenaikaiselle välilevyjen rappeutumiselle ja sitä kautta välilevytyrälle. Vuonna 2017 tutkijat Davisin yliopistossa Californiassa (Brown et al. 2017) todensivat tutkimuksissaan, että mikäli tuo FGF4-geeni sijaitseekin kromosomissa 12, aiheuttaa se selkeästi isomman riskin välilevyjen ennen aikaiselle kalkkeutumiselle ja täten myös altistaa koiran normaalia voimakkaammin välilevytyrälle (kondrodystrofia = CDDY). Puhutaan Hansenin 1-tyypin välilevysairaudesta (IVDD = intervertebral disc disease).

Tämän löydön myötä tutkijat ovat kehittäneet geenitestin, jolla pystytään määrittelemään kummassa kromosomissa lyhytraajaisella koiralla tuo geeni sijaitsee. Geenitestituloksena koira voi olla joko N/N eli koira ei kanna kyseistä kondrodystrofian / -dysplasian muotoa tai CDPA/CDPA eli lyhytraajainen koira tai CDDY/CDDY eli lyhytraajainen koira, jolla on merkittävästi kohonnut riski sairastua välilevytyrään välilevyjen kalkkeutumisen seurauksena. Jo pelkkä kantajuus (tulos N/CDDY) nostaa riskiä huomattavasti (jopa 15 kertaiseksi Hannes Lohen mukaan). On myös huomioitavaa, että kantajalla on myös 50% mahdollisuus jättää jälkeläisilleen tämä isomman riskin versio.

Jalostusohjeessa sanotaan kondrodystrofian osalta seuraavaa: ”Suositellaan CDPA/CDDY- geenitestin teettämistä. Tuloksen N/CDDY saanut koira tulee parittaa vain tuloksen N/N saaneen koiran kanssa. CDDY/CDDY-tuloksen saanutta koiraa ei suositella käytettäväksi jalostukseen.Geenitestien lisäksi ja niiden tuloksista huolimatta, suositellaan selän röntgenkuvaamista kalkkeumien todellisen määrän selvittämiseksi.”

Myös ns. villityypin geenin (kondrodysplasia) kantajien (N/N ja N/CDPA) löytäminen ja mahdollisuuksien mukaan säilyttäminen kannassa olisi ensisijaisen tärkeätä.

Kun geenitesti on tehty ja se on molempigeenisesti sama, esim. IVDD:n suhteen  CDDY/CDDY tai N/N ja kondrodysplasian suhteen CDPA/CDPA tai N/N, se on voimassa kahdella seuraavalla sukupolvella, kolmas sukupolvi pitää uudestaan testata. Mikäli koiran molemmat vanhemmat tai isovanhemmat on geenitestattu CDPA/CDDY-testillä ja kaikilla on sama tulos joko testistä tai 1.polven jälkeläisen osalta (esimerkiksi: isä: CDDY/CDDY + emä: CDDY/CDDY ja isä: CDPA/CDPA + emä: CDPA/CDPA) voidaan koira lisätä listalle vanhempiensa geenituloksen pohjalta samalla tuloksella kuin vanhempansa. Mikäli siis koirasi täyttää em. ehdot, voit ilmoittaa oman koirasi listalle

Jos luet sivua kännykällä, käännä näyttö vaakatasoon, jotta taulukoissa olevat tiedot näkyvät kokonaisuudessaan.

Monimuotoisuustesti

Labogeniltä on saatavissa myös monimuotisuustesti, mikä kertoo sinulle koirasi koko geenirakenteen haplotyyppeinä ja koirasi oman geneettisen monimuotoisuuden asteen. Tällä testillä meidän olisi mahdollista parantaa rotumme geneettistä monimuotoisuutta, jos saamme testattavien koirien määrän mahdollisimman korkeaksi. Mitä monimuotoisempi rotu on geneettisesti, sitä paremmat mahdollisuudet ovat, että esimerkiksi autoimmuunisairaudet ja lisääntymisongelmat pysyvät hallinnassa.

Testattuasi koirasi saat tulosten mukana myös kirjautumistyökalun Labogenin omaan tietokantaan. Antamalla koirasi tulokset julkiseksi tietokannassa, pääset näkemään kuinka kaukana oma koirasi on geneettisesti muista Labogenillä testatuista ja julkistetuista havannankoirista. Mitä isompi testattujen ja julkistettujen koirien määrä tietokannassa on, sitä luotettavammin sitä voidaan käyttää yhtenä jalostuksen työkaluna yhdistelmiä suunniteltaessa.

Jos teetät koirallesi ko. testin, ilmoitathan tulokset myös geeniyhdyshenkilöille!

Yhdistyksen geeniyhdyshenkilö

• Kaija Männistö

Yhteistyö Koirageenit-työryhmän kanssa

Hannes Lohen Koirageenit.fi -sivuilla kerrotaan heidän työstään mm. seuraavaa: ”Koirien perimän kartoituksen myötä on avautunut ainutlaatuisia mahdollisuuksia eri rotujen perinnöllisten sairauksien, rakenteen, värin, koon ja käyttäytymispiirteiden selvittämiseen. Tavoitteenamme on tunnistaa geenivirheitä koirien erilaisiin perinnöllisiin sairauksiin ja ominaisuuksiin, kehittää geenitestejä jalostuksen apuvälineeksi ja soveltaa saatua tietoa ihmissairauksien selvittämiseen. Ihmisen ja koiran geenit ja sairaudet ovat pitkälti samat. Geenilöytö avaa useimmiten myös mahdollisuuksia tautimekanismien ymmärtämiseen ja se luo pohjaa diagnostiikan ja parempien hoitojen kehittämiseen.” http://www.koirangeenit.fi/

Lohen tutkimusryhmä on jo vuonna 2010 saanut tutkimustensa pohjalta valmiiksi havannankoirien lyhytkarvaisuutta aiheuttavan geenin testin. Tällä hetkellä Lohen ryhmällä ei ole havannankoirille menossa aktiivisia tutkimuksia, mutta uusia näytteitä (varsinkin sairaista sekä vanhoista, terveistä yksilöistä) he ottavat vastaan enemmän kuin mielellään.

Havannalaiset ry tukee geenitutkimusta varten tehtäviä näytteenottoja. Lisää aiheesta voit lukea täältä.

Mikäli lähetät tutkimusryhmälle koirastasi näytteen, muista ilmoittaa asiasta myös geeniyhdyshenkilöille. Mihin sairauteen/ongelmaan liittyen näyte lähetetään ja mistä koirasta?

Mikäli olet lähettänyt Lohen ryhmälle koirastasi verinäytteen, muista päivittää tieto koiran terveydessä tapahtuneista muutoksista / kuolinsyystä (mikäli sairaus) myös tutkimusryhmälle! Tähän tarvittavat tiedot löydät osoitteesta: http://www.koirangeenit.fi/osallistuminen/terveystietojen-paivittaminen/